Formé de multiples îles et îlots, le golfe du Morbihan où se situe la base de Port-aux-Français constitue la plus grande baie des îles Kerguelen. On y observe une sous-espèce endémique du Dauphin de Commerson classée en danger d’extinction en raison de la petite taille de sa population. Avec l’extension de la réserve naturelle dans les zones économiques exclusives de Crozet, Kerguelen, Saint-Paul et Amsterdam, ce golfe est passé d’un statut de protection marine « classique » à « renforcée », où toute activité industrielle et commerciale est interdite.
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